1%ヒアルロン酸水溶液　は　振った場合　高分子量化しますか？低分子量化しますか、変化ありませんか？

ヒアルロン酸は、１％溶液中でならば、基本的に高分子となります。

最も大きなヒアルロン酸分子の立体構造が占める大きさから、分子は１g/lオーダーの濃度で完全に溶液空間を満たすと計算できる。それより高濃度になると分子は絡まり出し、溶液中でヒアルロン酸鎖は連続的なネットワークを形成する。
http://glycoforum.gr.jp/science/hyaluronan/HA23/HA23J.html#V

ちなみに、高分子になると粘度が増しますので、世間で売られている１％で「溶液」状のものは、塩や酸を加えるなどの方法により、いわゆる「低分子化処理」をされた状態のもの（自然にはほとんど存在しない）です。

さて、ご質問の内容は、これを攪拌したとき、分子は結合するのか分離するのか、ということと考えますが、
・自然には高分子化するので、ゆるやかに静かに混ぜれば、結合は当然促進されます。
・ただし薬品等で処理されたものは、変化に対して抵抗性がある可能性があります（すなわち、ほとんど変化しない）。
また、次の実験からは（２％での実験のため、結合の度合いは一層強い）

自動攪拌器を用いて攪拌。攪拌15分後，培養ヒアルロン酸は粘度の著しい低下が認められた
http://www.tcichemicals.com/ja/jp/product/glyco-chem/information/hyaluronic_acid.html

・粘度低下＝低分子化。すなわち、「強く攪拌すれば、結合は物理的に切断される」。
と言えると考えられます。

化学反応が生じないかぎり正確な意味での高分子量化はしません。（高粘度化はありえます）
化学反応が起こるきっかけとして日常的な用語でいうシェイク振動そのものはたいしたエネルギーではなく、むしろ握った「体温」や振動による「加温」のほうが効く可能性があるくらいです。
閾値を下げる触媒の有無が肝心になります。
　
他の質問で理系修士卒と自己紹介しておられました。
ならキーワードをあげればたぶんご自分でお求めのものをご理解のうえ選択されるとおもいます
　
コロイド・凝集・分子の会合・タンパク質の結晶・ファンデルワールス力
チキソトロピー・ダイラタンシー・コラーゲンの三本鎖
　
以上。
　
なお、イオン結合と共有結合とファンデルワールス力の区別を正確に理解していないことは大学どころか中学レベルの化学からのつまづきがあるとみなせます。そのような化学的素養の欠けた方にはなにを解説しても正確に理解されない、どこかで再び混同がおこるだろうと個人的におもっています。