ワードプレスのページ遷移でtrueを入れても同一カテゴリー内でページ遷移しません。

気がついた事がありますので追記します。

カテゴリー限定(「$in_same_term」をtrue指定)した場合、「rel」属性の「link」タグに影響しますので、次の対処が必要になります。
以下のコードを「functions.php」に追加します。

function custom_rel_link() {
	if( is_single() ) {
		remove_action( 'wp_head', 'adjacent_posts_rel_link_wp_head' );
		add_action( 'wp_head', 'adjacent_posts_rel_link_in_taxonomy' );
	}
}
add_action( 'wp_head', 'custom_rel_link', 1 );
function adjacent_posts_rel_link_in_taxonomy() {
	adjacent_posts_rel_link( $title = '%title', true );
}

※個別投稿ページの場合、デフォルトのrelリンクタグを出力するアクションを削除して、カテゴリー限定のrelリンクタグを出力する関数を実行するアクションを追加し直しています。


※カテゴリー内限定「$in_same_term」だけでなく、除外カテゴリー「$excluded_terms」やタクソノミー指定「$taxonomy」にも対応するには、プラグインで対応してもらった方が便利ですので、サポートフォーラムでお願いしてみました。
対応してもらえるかは分かりませんが、
・$in_same_term,$excluded_terms,$taxonomyパラメータへの対応
https://wordpress.org/support/topic/in_same_termexcluded_termstaxonomy%e3%83%91%e3%83%a9%e3%83%a1%e3%83%bc%e3%82%bf%e3%81%b8%e3%81%ae%e5%af%be%e5%bf%9c

※プラグインで対応した場合には、回答内のコードによる対処は必要なくなりますが、relリンクタグに対処する為のコードは必要です。
※除外カテゴリー「$excluded_terms」やタクソノミー指定「$taxonomy」を指定した場合は、relリンクタグに対処する為のコードも変更が必要になります。

指定するパラメータの順番は次のとおりになります。(3番目に除外カテゴリー(ターム)のID、4番目にタクソノミーの種類をナビゲーションリンクを出力する関数での指定と同じように指定します。)
「/wp-includes/link-template.php」

/**
 * Display relational links for the posts adjacent to the current post.
 *
 * @since 2.8.0
 *
 * @param string       $title          Optional. Link title format.
 * @param bool         $in_same_term   Optional. Whether link should be in a same taxonomy term.
 * @param array|string $excluded_terms Optional. Array or comma-separated list of excluded term IDs.
 * @param string       $taxonomy       Optional. Taxonomy, if $in_same_term is true. Default 'category'.
 */
function adjacent_posts_rel_link( $title = '%title', $in_same_term = false, $excluded_terms = '', $taxonomy = 'category' ) {
	echo get_adjacent_post_rel_link( $title, $in_same_term, $excluded_terms, true, $taxonomy );
	echo get_adjacent_post_rel_link( $title, $in_same_term, $excluded_terms, false, $taxonomy );
}