PtoPもTCP/IPが利用されているのでしょうか｡それとも､ちがうプロトコルなのでしょうか｡

インターネットの定義はいろいろあるようですが｡そのひとつがTCP/IPが利用されているかどうかだと思っています｡

様々な仕組みを組み合わせて利用しているものが所謂インターネットですので、この解釈にしてしまうと正しくない部分が出てきてしまいます。

JPNICでは、以下のように解説されています。(抜粋)

語源的にはネットワークとネットワークをつなぐものが、 すなわちインターネットです。 英語だと、小文字で始まるinternetがこれに相当して、 LANとLANをつないだもの、 というイメージになります。

対して日本でインターネット、 英語では大文字で始まるThe Internetのほうは、 もっと限定的です。 これはIPという約束に従って接続された、 世界規模のコンピュータネットワークを意味します。
インターネットとは - JPNIC

インターネットを使った(ピアツーピア/P2Pなどを含むすべての)アプリケーションは、OSI参照モデルというものに当てはめて説明することができます。

これは、機能を階層ごとに分離して整理したものになります。

7. アプリケーション層
6. プレゼンテーション層
5. セッション層
4. トランスポート層
3. ネットワーク層
2. データリンク層
1. 物理層
インターネット用語1分解説?OSI参照モデルとは? - JPNIC

※これは、一つの解説方式であり、これに当てはまらない解説も存在します。

このモデルでは、コンピュータなどを物理(電気や電波)的に接続する「物理層」、物理的に接続されたもの同士を管理する「データリンク層」、そして、接続された様々な機器との通信を行うための「ネットワーク層」とつながっています。

このモデルでは「ネットワーク層」がIP(Internet Protocol/インターネット プロトコル)に当てることができます。(TCP/IPの IP 部分)
IP (Internet Protocol)とは - JPNIC

更に上の階層「トランスポート層」では TCPやUDPなどの転送方式があり、これらの上で様々なアプリケーションが動作して通信を行います。
インターネット用語1分解説?TCP/IPとは? - JPNIC

機能を7つに分けたモデル以外にも「インターネット・プロトコル・スイート」があり、こちらは大きく4層に分けてあります。

4. アプリケーション
3. トランスポート
2. インターネット
1. リンク
インターネット・プロトコル・スイート - Wikipedia

現在のインターネット上では、遅延の少ないUDPと組み合わせて音声や映像を転送するRTPや認証や暗号化を行い安全に接続するために利用するTLSなどを組み合わせる事が多く、OSI参照モデルでは複数の層に当てはまる状態になることがあります。
インターネット用語1分解説?UDPとは? - JPNIC


P2Pとは、特定のサーバを介さずに対象のコンピュータ同士で直接通信を行い、自身がサーバ/クライアントの機能を持つ仕組みです。この仕組みは特にインターネットを介さずに実現することも可能です。
インターネット用語1分解説?P2Pとは? - JPNIC

インターネットと呼ばれる安価で簡単に接続できるネットワークを利用して実現しているアプリケーションの一つです。


通信上の相手を特定できる「3.ネットワーク層」または「2. インターネット」まで利用できれば独自の通信が可能になります。このため、質問の

PtoPもTCP/IPが利用されているのでしょうか｡それとも､ちがうプロトコルなのでしょうか｡

の答えは、アプリケーションにより、異なる。ということになります。

多くは既に開発された不具合の少ない安定した仕組み(TCPやUDP、その上にあるTLSや各種プロトコル)を利用することでアプリケーションの開発に専念することができるため、いずれかの方式であると考えられます。