ArduinoのPWMが出力されない

arduino nanoでpulseIn関数とpwm出力の実験をしています。
A1,A2,A3ピンに入力したパルスをpulseIn関数で読み取り、その値に応じて5,6,10,11番ピンからpwm出力をするものです。
パルスの読み取りは出来ており、5,10番ピンのpwm出力は安定しています。
しかし、6,11番ピンのpwm出力が不安定です。
簡易オシロスコープで波形を確認すると、基本0Vで、不規則に一瞬だけ5Vになるという感じでした。
別のarduinoに交換しても同じ現象が発生しました。
プログラムや配線に間違いはありません。
原因は何でしょうか。分かる方いらっしゃいましたらご教授願います。