今、mecabで形態素解析した結果です。これでどうでしょうか？
読む 動詞-一般 こと 名詞-普通名詞-一般 に 助詞-格助詞 し 動詞-非自立可能た 助動詞 の 助詞-準体助詞 で 助動詞 ある 動詞-非自立可能
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コメント（2件)
https://dictionary.goo.ne.jp/word/である/
https://detail.chiebukuro.yahoo.co.jp/qa/question_detail/q10103434715
現在も「段差あり」のように標識等に古語の名残はありますが。
まあ学校文法ではNo. 1でいいはずです。学問的には問題はあるので文法学者によって違うはずです。