こちらを見つけましたのでお伝えしますね。
データを修復するまえにコピーをとっておくことをお勧めします。
(私は心配性なのもあり、修復するときはコピーした方を復元しています)
http://ameblo.jp/nekocat2/entry-11515276030.html
Motonoriさんと同じような境遇でm4aファイルを修復したかたの修復記録です。
少しでもご参考になりますと嬉しいです。
また他も見つけましたら追記いたしますね。
これが参考になるのではないでしょうか?
http://detail.chiebukuro.yahoo.co.jp/qa/question_detail/q1199706591
あと、ファイル名も確認してくださいね。
VLC メディアプレイヤーのバージョンを確認してみてください。
少し古いバージョンですが 1.1.4 にはいろいろ問題があるようですので、該当するバージョンであればアップデートしてください。
http://makoto.forzamilan.jp/archives/2933
http://offnet.blog4.fc2.com/blog-entry-49.html
m4aファイルが再生できない - 挑戦者BBS
iTunesを使ってAACファイル(.m4a)をmp3に変換する方法 Convert to .mp3 at iTunes | WEB HORIC.
AACファイル(.m4a)をmp3に変換してみてください。