単に､その Another HTML-lint5 の方が､only の存在をぺろっと忘れているだけの気がします｡
自称検査機が正しい検査をしているとは限りません｡

/html-lint/html5.rul

'MediaType'=> '^(?=^\s*(not\s+)?(all|aural|braille|handheld|projection|print|screen|tty|tv){1}(\s*,\s*(all|aural|braille|handheld|projection|print|screen|tty|tv)\s*)*((\s+and\s+|\s*,\s*)(\(\s*((min-|max-)?(width\s*:\s*\d+px|height\s*:\s*\d+px|device-width\s*:\s*\d+px|device-height\s*:\s*\d+px|aspect-ratio\s*:\s*\d+/\d+|device-aspect-ratio\s*:\s*\d+/\d+|color\s*:\s*\d+|color-index\s*:\s*\d+|monochrome\s*:\s*\d+|resolution\s*:\s*\d+dpi)|((orientation\s*:\s*(landscape|portrait))|(scan\s*:\s*(progressive|interlace))|(grid\s*:\s*(0|1))))\s*\)))*\s*$).*$',

･･･なんだこのやっつけ仕事｡

そういうわけなので only を取り除けばこの検査機は文句を言わなくなるはずですが､実際にそんな事をしたら意味が変わってしまうので､この場合は警告をなまぬる?く無視しておくのが正しい対処かと思われます｡

ちなみにｵﾘｼﾞﾅﾙの Another HTML-lint では､単に 'MediaType'=>'CDATA+' になっているだけなので､たいてい何を書いても文句言いません｡