http://www.konami.co.jp/am/bm2dx/
beatmania IIDX GATEWAY
ご存じの通りかと思いますが、HES氏という方が制作しているそうですよ。使用ソフトは何を使っているかまでは調べられませんでした。が、参考までに同じゲームやVJが使っているソフトの紹介がなされているページを紹介します。
映像系は大概Photoshop+AfterEffectsは使われています。又3D画像を作るソフト。例えばMaYa,Lightwave,Shade,SOFTIMAGE XSI,Macromedia Director等が有名処ですね。
ビートマニアってVJっぽいのでここが参考になるのでは?