http://www.yayoi-kk.co.jp/icare/verup/
弥生株式会社 サポート&サービス_バージョンアップ
こんにちは。弥生株式会社のサポートページに、新製品に旧バージョンからのデータコンバータ搭載と掲載されているので、買い替えられても大丈夫だと思います。ただ、バックアップしたデータが破損していたら、なんともなりませんけど...
あと、今はフロッピー以外にフラッシュメモリやSDメモリなどの大容量記憶媒体があるので、そちらを使うことがお勧めです。けっこう信頼性も高いと思います。