アフィリエイト向けにCSVを使ってサイトを構築する本」なんてとても範囲の狭い情報を扱っているものは恐らく存在しません。
一番簡単な方法としてはデータベース(MySQL)+PHPでサイトを構築するやり方でしょうか。
現在レンタルサーバーでアフィリエイトサイトを運営されているんだと思いますが、サーバーでPHPとMySQLが使えるのならばぜひ勉強される事をお薦めします。
私はHTML+CSSしか知らない状態から、1ヶ月程度で簡単なPHP+MySQLサイトを作ることが出来ました。
お薦めの本はこれでしょうか。
http://www.amazon.co.jp/MySQL%E5%85%A5%E9%96%80%E4%BB%A5%E5%89%8...
とりあえずこちらの本を3日程度「最初から順番に読んで勉強」すれば、質問者さんのやりたい事はできるようになるはずです。
追記)
データベースを駆使してサイトを作れるようになると、今まで手作業でHTMLを作っていたのが馬鹿らしくなるほど効率が良くなります。おのずと収益もUPする事でしょう。ただ、PHP+MySQLはそんなに簡単に習得できる代物でもありません。私もまだまだです。プログラミング言語の中では圧倒的に簡単な言語らしいですが、腰を据えて勉強される事をお薦めします。
ただ、スパム認定されても、そのサイトを捨てればいいだけなので、
アフィリエイターは特に痛手も無いようです。