Vista HomePremium(32bit)で最新版のSleipnir2.5.17を使っています。
タブをホイールクリックで閉じるはデフォルト設定ですし、問題なく利用できました。
それでダメということであれば、なにか細部の設定がおかしいのだと思います。
一番疑わしいのは、オプション→ユーザーインタフェース→マウス割り当て→ホイールクリック です。
デフォルトでは「OpenLinkNewWindow」ですが、どうでしょうか。
これでダメなら設定ファイルを初期状態に戻してみましょう。
C:\Users\<ユーザー名>\AppData\Roaming\Fenrir & Co\Sleipnir\setting\
このディレクトリに「user.ini」というファイルがあります。
これがオプションなどの設定情報になります。
このファイルを削除(もしくはデスクトップなどに隔離)してください。
※AppDataというフォルダは隠しフォルダです。表示されない場合は、コントロールパネル→デスクトップのカスタマイズ→フォルダオプション から変更してください
この状態でSleipnirを起動すると、「user.ini」が新しく自動で作られて初期設定にもどります。
起動時にお気に入りのインポートを促されますが、キャンセルしてしまって大丈夫です。
わたしも新規購入した富士通のノートパソコン(Windows Vista)で同様の症状に苦しみました。
どんな場面でもホイールクリックが使えなかったので、マウスへのキー割り当ての問題であると推察し
どうにかそれを変更できないか試しましたができませんでした。結局、はじめから入っていた
マウス設定ツール(Setpoint)をアンインストールすることで解決しました。