PubMedに収載されないというのは、雑誌のランクが低いと考えられているからだと思います。(雑誌のランクですので、学会のランクと直接の関係はないと思います。)
雑誌のランク付けには、インパクトファクターという指標が良く使われます。
引用回数が多いほど、雑誌の有用性・質が高いといわれています。
ただ,万能というわけではないので、最近のIF偏重に問題を唱える人もいます。
http://www.lib.hiroshima-u.ac.jp/topics/jcr_200508.html
http://wwwsoc.nii.ac.jp/zsj/news/data/2005_11Z.pdf
http://wwwsoc.nii.ac.jp/zsj/zool/html/01_infopublic/topics/0610_...
http://www-lib.shinshu-u.ac.jp/seni/online/no32/hochi.html
http://www-lib.shinshu-u.ac.jp/seni/online/no32/hochi.html
因みに学会のランクは、メンバー数と主構成メンバーにどのような人がいるか、などで決まるように感じています。メンバー数は多ければ多いほど、主要メンバーには世界的な権威が名を連ねていればいるほど、ランクが高いという評価のようです。