ほぼ同時期にサボテン公園にもF-104があったそうです。時期が前後するだけで同じ機体なのか、違うかもわかりません。マーキングは動物園の方も当時の第5航空団、新田原基地のものだったと記憶しています。動物園の機体が撤去後にどこに行ったのか、あるいは処分されたのかも調べています。
宮崎のF-104はこれでしょうか。
http://photozou.jp/photo/tagged/75368/%B5%DC%BA%EA
サボテン公園のものは、これだと思います。
http://ksa.axisz.jp/a8601KoukuU.htm
その他、F104情報をぐぐってみました。