IME 2007 をご利用でしょうか。だとすると、環境によっては不具合が発生するようです。
IMEのパッチ「Hotfix Rollup for Office IME (Japanese) 2007」を当てる。
IE7の保護モードを解除する。⇒(参考サイト)世の中は不思議なことだらけ : Windows VistaのIME
2002でトラブル発生していますね。
http://support.microsoft.com/kb/873091/ja
・CSSまたはjavascriptでime-modeを指定すると現象が出る
・ローマ字入力よりカナ入力の方が現象が出やすい
・FireFoxは、ime-modeをサポートしないので現象は出ない
ありがとうございます。困ったことに FireFox でもでました。。。。
IME2003にすると治ることがありますよ。