二輪での通勤は時間面で不安定です。これは自動車にも言える事ですが。
二輪は「無理をすれば早く着けたり」しますので…色々と気をつけて下さい。
さいたま~松浜まで 30 km ほどですが、この程度の距離ならば 50 cc のスクーターでも何とかなります。
ビッグスクーターは横方向に結構と駐車スペースを必要としますので、駐車場の確保が必須となります。
恐らくは会社の方に駐車場があるのだと思いますが、休日の街乗りでは駐車場所に困ったりもします。
(法律的には合法的にそこらに停められるものの、結構と邪魔になってしまいますので)
また、降りてからの取り回しが結構大変です。個人差もありますが、私は 1000 cc の二輪を取り回す位に疲れます。
通勤利用に割り切るなら、上記で seble 様もおっしゃっている通り、オフロードタイプの方が適しているかもしれません。
二輪は風圧で人間が疲労します。目には見えませんが、長距離乗って疲労するのは風圧による影響が非常に大きいのです。
ただ、これは 200 ~ 300 km 以上を走行しない限りはあまり感じられないと思います。
ですのでカウルの有無はさほど気にされなくても良いでしょう。
(雨の日に高速走行すると濡れにくいとかもありますが、法定速度以上の話になってしまいますのでそれはそれで)
免許の関係もありますが、クラッチ (ギア) ありかどうかは慣れれば全く関係無い気がします。
渋滞に巻き込まれた時に多少左手 (クラッチ側) の握力が鍛えられるかどうか位でしょうか(笑)
私は片道 50 km ほどを毎日気分によって 50 cc ~ 1000 cc の何台かを使い分けて通学/通勤しておりましたが、
正直言ってこの程度の距離ならばどれでも同じ感じです。一長一短ですね。
質問の回答としては、二輪が好きなら全然余裕です。
ただ、ビッグスクーターだからといって自動車並みに楽になるといったイメージをお持ちでしたら、
話が若干変わってくるかもしれません。悪天候の日はやはりそれなりに大変です。
P.S.
http://okwave.jp/qa2157366.html
URL が必須の設定となっておりますので、冗談半分で「おすすめ スクーター」で検索してみました。OKWave の回答です。
こういう回答を何食わぬ顔で「自分の意見として」コピー&ペーストしてしまう回答者さんがどうのこうの(苦笑)