HDDが壊れかけていて、HDDのデータを読むのに時間がかかっているような気がします。
立ち上がり時は、特にHDDから(OSを)連続的に読み続けていることと、CF-W4はファンレスなので、音を出しそうなパーツはHDDと光ディスクドライブぐらいしかない、ということが理由です。
HDDはパーツの中でも壊れるのは早い方で、5年ならそろそろ危ないです。
そうだとすると、HDDの交換、修理で直すことになります。
その前に、とりあえずはいつ完全に壊れてもいいように、HDDのデータのバックアップをした方がいいと思います。
ハードディスクにセクタ異常が発生しているのかもしれません。
下記を参照に、ディスクチェックを実行してみて下さい。
http://www-06.ibm.com/jp/domino04/pc/support/beginner.nsf/btechi...