>アマゾン側は指摘を不服として2国間協議を申請、日米の税務当局が扱いを協議しているという。
http://www.risuku.net/article/13494215.html
アマゾンとしては、
>支店などの恒久的施設を日本国内に持たないため、日米租税条約に基づき日本に納税する必要がないと判断し、申告しなかった。
http://taxzeikin.blog115.fc2.com/blog-entry-50.html
と解釈の問題として、日米の税務当局に投げた形です。
続報は見当たらないので、まだ協議中もしくは日本の国税局の「負け」で現行のままでしょう。