Linuxサーバをお捜しですよね。
プラットホームのOpenBlockS 600はいかがでしょう。サイズは81(幅)×133(奥行)×31.8(高)ミリ、重量は約265グラムです。
CFカードを内蔵してドライブとして利用することができます。
MacMiniはスペック的に問題ないと思います。
少し高いのが難点ですが、中古だと3万円程度で購入できたりします。
CPUがPowerPCだと開発に支障が出るかもしれないので、Intelのものをお勧めします。
APPLE Mac mini 2.26GHz 2GB 160GB MC238J/A
openCV,gphoto には役不足な気がします。