Xindiceを.NETから利用するにはどうすればいいでしょう？

Apache XindiceはJavaからの呼び出しが基本ですが、それ以外のインターフェイスとしては CORBA や XML-RPC がサポートされています。

CORBAの場合

今のところ .net には CORBA のサポートはありません。ボーランドから Janeva という CORBA にアクセスできるミドルウェアが発売されていますので、これを利用すればよいです。

XML-RPCの場合

XML-RPC.NET という.NET 環境からXML-RPC を使うためのオープンソースのプロジェクトがありますのでこれを利用すればよいでしょう。

検索してみるとC#でのXML-RPCの使用例が見つかりましたので貼り付けておきます。