トラックバックを受け付けることのできる掲示板のフリーcgiはないでしょうか。

こちらはどうでしょう。

スレッド形式ではない掲示板につけたい場合、このcgiを使うと、任意の掲示板cgiにトラックバック機能を付け加えることができます。

トラックバックのできる掲示板というのは、レスができればいい、というわけではないのでしょうか？

具体的には、トラックバック先アドレスを表示するのと、URLを必須入力項目にできればいいのでしょうか？

もしそうなら、上記のサイトの（ほかのレス式掲示板でも可）を少しカスタムすればできると思います。

少々ニュアンスが違うのかもしれませんが、Blosxomというブログツール（Perl）を掲示板化して使うことができます。

その場合、元がブログツールなので当然トラックバックを受けるようにすることもできます。