ちょっと分からないんですが。

http://web.sfc.keio.ac.jp/~t04628hn/gakkyokuwohappyousuru.html

どんなファイルフォーマットのものを、どのような形式で掲載したのでしょうか？

自動再生させるには上記ページのような方法で行うこともできます。

もし上記の方法で掲載しているのであれば（HTMLエディタの機能などで）上のページを参考にして対処できるはずです。

全サイトにて音楽の自動再生をオフするの場合

　１.InternetExplorerのメニューの「ツール」ー「インターネットオプション」

　２.「詳細設定」タブの「Webページのサウンドを再生する」のチェックをクリア

ではどうでしょうか？？

自動スタートさせたくないということでしょうか？

最近よく見かける、Flashを使ったプレイヤを使ってるならやり方が変わってくる（その場合使ってるサービスによって異なる）のですが、基本的なやり方で、<embed>タグを使ったものなら以下のようにすれば自動再生されません。

<embed src="ファイル名" autostart="false" >