mysqldump -u DBUSER -p DBNAME40 > DBNAME.sql
mysql -u DBUSER -p --default-character-set=utf8 DBNAME41 < DBNAME.sql
だと上手くいかない場合があります(\関係でsyntax errorが出る)
No.1
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60pt
4.0と4.1はもはやマイナーアップではないですよね（苦笑
日本MySQLユーザ会はごらんになりましたか？ 仔細はわかりませんが、環境をいじれる立場であれば、
http://www.mysql.gr.jp/frame/modules/bwiki/?FAQ#content_1_48
（その前後）を参照すれば解決するかも？
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