Apache2利用しています。

http://httpd.apache.org/docs/2.0/ja/howto/cgi.html

設定変えたら、Apache2の再起動がたぶん必要

/var/www/html以下を利用する場合で書いてみようと思います。

前からいきますと、

DocumentRoot /home/httpd/html

ここは、

DocumentRoot /var/www/html

の方が良いでしょう。

<Directory />
    Options ExecCGI FollowSymLinks
    AllowOverride All
</Directory>

ルートは出来れば最低限の実行になるように、

<Directory />
    Options FollowSymLinks
    AllowOverride None
    Order Deny,Allow
    Deny from All
</Directory>

等とした方が…。

<Directory /home/httpd/html>
    Options Indexes Includes ExecCGI FollowSymLinks MultiViews
    AllowOverride All
    Order allow,deny
    Allow from all
</Directory>

ここを、

<Directory /var/www/html>
    Options Indexes Includes ExecCGI FollowSymLinks MultiViews
    AllowOverride All
    Order allow,deny
    Allow from all
</Directory>

のようにして、/var/www/htmlを設定。

あと、

ScriptAlias /html/ /var/www/html

ここをコメントアウト

# ScriptAlias /html/ /var/www/html

とかでどうでしょうか…。

うまくいかないようでしたらすみません。

関係ありそうな所をザッと見てみました。

DocumentRoot /home/httpd/html
<Directory />
    Options ExecCGI FollowSymLinks
    AllowOverride All
</Directory>

<Directory /home/httpd/html>
    Options Indexes Includes ExecCGI FollowSymLinks MultiViews
    AllowOverride All
    Order allow,deny
    Allow from all
</Directory>

UserDir public_html

ScriptAlias /html/ /var/www/html

<Directory /var/www/html>
    AllowOverride None
    Options ExecCGI
    Order allow,deny
    Allow from all
</Directory>

AddHandler cgi-script .cgi .pl

これらより、

http://localhost/test.cgi でのアクセスは、/home/httpd/html/test.cgi を実行しようとします。（このディレクトリにはCGIの実行が許可されていて、○○○.cgi, △△△.pl へのアクセスは、CGI とみなされています）

http://localhost/~hoge のようなユーザ指定のアクセスは、/home/hoge へのアクセスとなります。

http://localhost/html/test.cgi へのアクセスは、/var/www/html/test.cgi を実行しようとします。

　　　　ScriptAlias /html/ /var/www/html は

　　　　ScriptAlias /html/ /var/www/html/ のように / が必要な気が...

ここまでで、

> /var/www/htmlでCGIを動かしたいのですが、

http://localhost/html/test.cgi とアクセスするという事ですよね？

この時のエラーメッセージはどう出ていますか？（ブラウザ上、Apache のエラーログ）

> /var/www/cgi-binでしか動作しません。

これは、どのようにアクセスしましたか？（単純にはこのディレクトリに到達出来な気がするので）

また、その時のログは？

動作する時の httpd.conf は、http://221b.net/httpd.txt の内容ですか？

CGIを動かす時には以下を参考にしました。

http://httpd.apache.org/docs/2.2/ja/howto/cgi.html#troubleshoot

http://www.rescue.ne.jp/CGI-BBS/server/apache/20030219005714.sht...