Windows付属の外字エディタで外字領域に登録した外字（○R、TMなど)を、

ASCIIの範囲==0x20～0x7Eの範囲に外字は通常定義できませんし、
外字領域の文字を用いることができるならUnicodeの文字も特に差支えはないと思うのですが…。

内部文字コードがShift_JISになっているようなアプリケーションでしょうか…。

ご指摘のように、内部文字コードがShift_JISが使われていると思われます。
MSゴシックなどでは外字が使えますが、Helveticaでは文字化けします。

また、確かにASCIIの範囲に外字の定義はできませんから、
一部の文字をつぶして置き換えることなどを想定しました。

であれば、Helveticaを改造したフォントを作成して、ASCII範囲で用いない文字を潰して任意の文字を作成したほうが早そうですね。
http://www.vector.co.jp/soft/win95/writing/se033302.html
のようなソフトウェアを用いて、
Helveticaを取り込んでMamotyHelveticaとでも名前を付けて
使わないであろう文字に®や™をどこかから拾ってきて当てはめればいかがでしょうか。

実はいろいろ調べて、TTEditは知っていました。
ですが、インストールしたHelveticaはTrueTypeではないので、編集できませんでした。
pfmという拡張子の、Type1形式のフォントです。
できれば、他の方法での回答登録をお待ちします。

#ところで、質問終了前にこういうコメント欄の使い方は、ありなのでしょうか？まいっか。

> #ところで、質問終了前にこういうコメント欄の使い方は、ありなのでしょうか？まいっか。
まぁ双方合意してればよいのでないでしょうか。(^^;

HelvericaとArialは一応等価なのでArialを元にできるとよいのですが、
Type1のフォントを用いることが必須なら難しいですね。
http://wiki.fdiary.net/font/?unixuser200403-3
http://edt1023.sayya.org/fontforge/ja/overview.html
まったく試してませんがこういうツールを使えば、Type1を出力できるかもしれませんね。

>まぁ双方合意してればよいのでないでしょうか。(^^;
いろいろおつきあい頂きありがとうございます。

手許のHelveticaがType1というだけで、Type1が必須というわけではありません。
なので、TrueTypeのHelveticaを購入するという選択肢はありあます。

で、どうせなら、和文フォントとして認識できるHelveticaはないだろうかというのが、元々の質問の趣旨でした。