倉庫に物を収納する時のコツを教えてください。

基本的にポジションプレーなんですね。
通路は必要ですが、通路が広いほどスペースファクターが悪くなる。
基本はセンターにメイン通路。ラインに一本ずつ枝分かれしたサブ通路ですが、狭くなってくると通路にまで物がはみ出して来る。
結局どの程度の出し入れがあるかを想定して、使う頻度の少ない物から奥に積んでいく。
できればセンター通路だけは確保した方が無難です。でないと、ほとんど全てが死蔵されてしまう。
棚も便利なようで痛し痒し。全ての箱が同じサイズなら丁度のサイズで棚を作れば最高ですが、最適化し過ぎると融通が利かなくなってしまう。
棚板や柱の空間も相当無駄になります。
結局、個人向けなら上下二段の棚ぐらいが使い易い。カテゴリー別にポジションを決めて、場所の要素で整理するのがお勧め。
どれくらいの広さの空間かによってレイアウトやコンセプトが変わってくるし、数年先には整理統合が必要になるでしょう。
　
夏場対策は一に日除け、二に換気。簾やよしずと換気扇でしょうか。屋根の上に寒冷紗（農業用の日除けの網です）を広げるのが一番お手軽。
物置専用の換気扇や換気扇付きの物置も市販されているようです。
　
湿気対策も必須です。
物置の場所そのものも、全体の中でのポジションプレーの一部になってくる。
普通は一戸建てだと北側の日当りの悪い場所で風の通り道。