家から会社まで、パソコンをバックに入れ背負って、会社まで走って通勤したいと思います。

走ってというのは通勤中に使う事がないということでしょうか？

会社に別のＰＣがないのであれば仕方ないのですが、

USB接続の外部記憶装置だけを運搬する方が軽いですしかさばりませんよ

SSDやSDカード(数十Gまで)なら重量は無視できる軽さです。

ドライブごと暗号化しておけばリュックごと紛失してもあまり心配しなくてすみます。

最近はデータを大容量SDカードで運ぶことが多いです。ビジネス手帳にも挿めますし。

HDDでもSSDでも非動作時はあまり関係ないはずです、バックアップを取るほうが大切。

転んだ時には応力で液晶の割れる方を心配した方がいいと思います。

あとは、

http://panasonic.biz/pc/toughbook/index.html

あたりの耐衝撃性にすぐれた製品を買うとかくらいでしょうか。

タフブックおすすめです。

http://panasonic.biz/pc/prod/note/u1/index.html

どこに重きをおくかがわからないので、1例としてCF-U1を挙げますが。

頑丈、防滴、SSD（も選べる）、小型という特徴があります。

大きめのモデルの場合HDDが簡単に取り出せるものもあるので、自分でSSD本体とコピーソフト（TueImageなど）と外付けUSB化機材（つながーるシリーズなど）も購入すれば、SSDへの換装ができます。

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余談ですがCF-18はヤフオクで入手しやすいです。

私はヤフオクでCF-18を買って自分でSSD化しました。

こちらを使われてはどうでしょうか。

高性能のリュック型パソコンバッグ！ バックパック　NBP-3 (C)

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パソコン機器を衝撃から守りアナタのビジネスライフをサポートしてくれるカジュアルなリュックタイプのパソコンバッグ★

背負って持ち歩きできるので両手がふさがらず便利♪

PCの中に顧客／社員情報や業務資料は入っているのでしょうか。

紛失・盗難も考えられますので、下記のようなUSBキーを使って業務用フォルダを暗号化しましょう。

KOKUYO EAM-UK500 USB認証キー(FILSAFER KEY)

• 出版社/メーカー: コクヨ
• メディア: エレクトロニクス

また、シャットダウンしていたり休止状態にあれば、HDDへの振動はそれほど問題になりません。むしろ、液晶ディスプレイの方が振動の影響を受けやすいと思います。