MPEG4ファイルを、DV-AVI形式のファイルに変換してくれるフリーソフトはないでしょうか？

前にも回答したと思うのですが、MPEG-4ファイルにはDV形式と同じタイムラインは含まれていません。
これは、DV方式が時間に対して固定倍率圧縮であるのに対し、MPEGシリーズは不定倍率であるためです。

しかし、作成（更新？）日時からタイムラインを算出することもできますよね？

うーん、言葉で説明するのは難しいのですが――。
DV形式の場合、たとえば5秒間で1000バイトの長さの映像（実際にはもっと大きなサイズになります；説明の都合上、こういう数字にしています）を約200バイトに圧縮するので、40バイトおきに1秒のタイムラインを付ければいいことになります。
ところが MPEG シリーズの場合、5秒間1000バイトの長さの映像が200バイトになるかもしれないし、100バイトになるかもしれないのです。ファイルの大木に対する圧縮率が一定しません。さらに、１コマ単位で圧縮しているわけではないので（極端な話、１分間連続する白い映像だと、１コマ分のデータに圧縮されてしまう場合がある）、データそのものにタイムラインを付加することも意味を成しません。

もちろん、再生時には圧縮されたデータを伸張するので、ファイル作成日時が撮影開始時と同じなのであれば、それに再生時間を加えた時刻がタイムラインになります。
この方法で MPEG-4 から DV形式にコンバートしつつタイムライン情報を付加するツールを作ることは可能だとは思いますが、残念ながら、私は見たことがありません。