windows マシンから linux サーバーにあるファイルを、SCPで定期的に自動バックアップしたいです。

ダウンロードしたファイルを、WSH でリネームしてはどうでしょう。

下記のスクリプトを拡張子 .vbs でセーブして、コマンドラインからバッチとして実行して下さい。

Dim ff, fs
Dim sour, sour_name, sour_ext

sour_name = "xxxx"    '元のファイル名
sour_ext  = ".zip"    '元の拡張子

'変更後ファイル名
dest = sour_name & "." & Year(Now()) & Month(Now()) & Day(Now()) & sour_ext

set fs = WScript.CreateObject("Scripting.FileSystemObject")
sour = fs.BuildPath("./", sour_name & sour_ext)
set ff = fs.getFile(sour)
ff.name = dest

参考サイト

• チェック式 WSH入門

私も、おそらくバッチファイルで実行するのが良いと思います。

WSHやVBSってセキュリティ云々とかけっこううるさいので、純粋にDOSコマンドシェルが妥当だと思います。

↓

ファイルのタイムスタンプを取得しリネーム(ローテート)する方法

http://typista.xii.jp/dos/304.html#extended

@echo off

if "%1"=="" goto :ERR_PARAM

if exist %1 goto :ROTATE

goto :NOT_EXIST

:ROTATE

SET TARGET=%1

SET T=%~t1

set YYYY=%T:~0,4%

set MM=%T:~5,2%

set DD=%T:~8,2%

echo move %TARGET% %TARGET%.%YYYY%%MM%%DD%

rem move %TARGET% %TARGET%.%YYYY%%MM%%DD%

goto :EOF

:ERR_PARAM

echo パラメータを指定してください。

goto :EOF

:NOT_EXIST

echo 指定されたファイルまたはディレクトリは存在しません。

goto :EOF

:EOF

rdiff-backup でいいんじゃね？ Win32 へのポートもあるようだし。

気まぐれサーバー - rdiff-backup - ローカル/リモートのミラーと差分バックアップ-rdiff-backup-気まぐれ Wiki

Cygwin の Cron

Windows 自身のタスクスケジューラーでやれば良いだけだと思うが。

　回答ではないのですが、Windows側に持ってきてバックアップするよりも、Linux側にHDDを増設するか、予備のLinuxマシンを設けて予備側にバックアップするなどして、Linux側でバックアップした方が、信頼性・バックアップ時間・HDDの使用量の点で有利ではありませんか?

　以下は、Linux用バックアップソフトで、初回のみファイルそのものをコピーして、2回目以降は変化が有ればやはりコピー、同じならハードリンクを使用する事によりHDDの使用領域を減らします。当然バックアップ時間も短くなります。その上、日付でディレクトリを作成してくれます。又、次のURLには、一定期間経過したら削除する事で、HDDのパンクを防ぐソフトも有ります。これをcronで毎日夜中に動作させればよいかと。

pdumpfs: Plan9もどきのバックアップシステム

tach.arege.net: pdumpfs-clean: pdumpfs のバックアップを掃除するツール

　最初のURLの方のソフトはWindows用も公開されていますが、Windowsでの使用では、ハードリンクが使用出来ないので、HDDの使用領域やバックアップ時間は減りません。