内閣府でＮＰＯ認証が降りた後、法務局で法人登記をせずに1年弱となりました。

活動予定がなかったので法人として課税されるのを嫌っての放置だったのですが、2年目に入る頃から活動をすることになりました。
（１）まだ法務局での法人登記はできるのか。何かペナルティはあるか。
（２）法人登記していなかった時間に対するＮＰＯ法人課税はあるのか。
お教え下さい。