usbで外付けにしたＨＤＤの物理エラーをチェックできるソフト探しています。

http://freesoft-100.com/pasokon/hdd_check.html

http://www.hdd-data.jp/support/downloads+175.html

HDD-SCAN（日本語）は如何でしょうか？

「ハードディスク状態を視覚的にわかりやすい表示で状態チェック、情報表示ができるソフトウェア。スキャンディスク（ディスク不良セクタ検査）、HDD情報表示、HDDの温度、使用時間などのS.M.A.R.T情報表示、HDD Read/Write状態モニタリング、デフラグ（Windows最適化）を行うことができます。外部リムーバルメディアである外付けハードディスクやUSBメモリーにも対応しています。」

http://xlife.sblo.jp/article/34142372.html

最新の英語版もあります。

どちらも「usbで外付けにしたＨＤＤの物理エラーをチェック」（バットセクターのチェック？）が

出来ると思われます。