起業を考えております。

本筋は起業でやっていける
（つまり売上げが上がる）
かどうかの問題で、登記とか青色申告とかはそれほど重要な問題ではありません。
起業するという事とアフィリで不安定という事とは基本的に変化はありません。
起業して資金を使っても売上げが伸びなければ倒産するだけです。
投資した資金はほぼ全て無くなりますから、アフィリだけ続けていた方がマシだったという事にもなりかねません。
起業したって利益が出なければ収入はゼロです。固定給が無いという点ではアフィリだろうと同じ事で、アフィリで生計を立てているという事はすでにそれで起業しているようなもんです。
（会社として登記されているかどうかの違い）
もちろんチャレンジなので得る物もあると思いますが、安定性のみを考えるなら何にもならないです。
起業、独立、よくあおられますが、それなりに目算がない業務でやっても失敗します。
どんな業務をするか？
という点が一番重要なのです。
あくまでこういう商売をしようという目的があって、そのための手段の一つに起業という手法があるに過ぎません。
目的が不明瞭、そこをおろそかにして、起業、独立ありきでやれば失敗します。
青色申告なんてのは儲かっちゃって、税金が多くなってから考えれば十分です。
（年商300万を十分超えてから）
それに平均12万、年150万ぐらいですよね？
すでに申告義務がありますよ。