ちょっと検索してもこの辺のことが（当たり前だからかなのか）探せなかったので・・・GAEとBigTableの関係について聞きます。BigTableを使ったアプリケーションを構築したいときは、BigTableを使うアプリケーションをGAE上にデプロイしなくてはならないのでしょうか？（GAEとBigTableはセット？）

BigTableはデータ圧縮された、高パフォーマンスのプロプライエタリなデータベースシステムである。Google File System（GFS）やChubby Lock Service、その他のいくつかのGoogleのプログラムで構築されている。今のところGoogle以外には供給されていない。

http://ja.wikipedia.org/wiki/BigTable

とのことですので、BigTable を単独で使用するのはいまのところ無理のようです。

ただ、下記のような BigTable を模して作られたオープンソースのプロジェクトがあります。

これらなら単独で使用することができます。

HBase

http://ja.wikipedia.org/wiki/HBase

Hypertable

http://ja.wikipedia.org/wiki/Hypertable

Cassandra

http://ja.wikipedia.org/wiki/Apache_Cassandra