ムームードメインのサブドメインのみをさくらインターネットのサーバーに向けたいのですが

サブドメインを　さくらインターネットのサーバに　割り振りしたいのは、Webページですか？
メールも含めてでしょうか？

ムームーDNSの設定方法 ( http://muumuu-domain.com/?mode=guide&state=custom_setup ) の手順で、５番の『[設定２]で、弊社サービス以外の、　 「ドメインを割り当てたいサービス」のレコード値を設定する』の設定を　行います。

以下のデータを入力します
●Web
サブドメイン：　割り振りしたいサブドメイン名
種別　　　　：　A
内容　　　　：　さくらのサーバーのIPアドレス
優先度　　　：　空欄でOK

●メール

サブドメイン：　割り振りしたいサブドメイン名
種別　　　　：　MX
内容　　　　：　さくらのサーバーのIPアドレス
優先度　　　：　10

を設定します。
設定したら　セットアップ情報変更」ボタンを押して、登録したら　完了です。

DNSの設定は、反映されるまで　数時間～数日かかることがあります。
すぐに反映されない場合は、しばらく待ってから　確認してください。