二台のデジカメを使っています。そのデジカメの画像データを同じファイルに入れると、同じ名前の画像ファイル名(カメラで自動的に作成されるもの)があると、同じファイル名のものを消去しますか？などと聞いてきます。同じ名前ではありますが、全く違う画像であるので、消さずにそのままコピーします。このような手間を省く簡単な方法はありませんでしょうか？

そのコピーファイル名のものを消去してしまえばいいんじゃないですか

カメラが違っていても同じファイル名である限り、コピーで上書きされてしまいます。
対策としては２つ考えられます。

１．カメラによってＰＣのフォルダを分ける

２．ＰＣ保存する際、カメラ名称を付けるなどしてファイル名を変更する。
WindowsでJPEG画像を保存するのであれば、下記のようなツールを使ってファイル名を一括変更できます。

Exif情報でファイル名が一括変更できる「Rexifer」

http://internet.watch.impress.co.jp/docs/column/biz_tool/20100804_385191.html

一度PCに保存して削除してからさせばいいんじゃないですか？

あなたが使っているパソコンがWindows7なら自由にタグをつけることが出来るはずよ。
http://support.microsoft.com/kb/981444/ja?wa=wsignin1.0

読み込み設定を変えることで取り込む全てのファイル名にタグを含めるようになるの。
http://windows.microsoft.com/ja-JP/windows7/Change-settings-for-importing-pictures-and-videos

メーカーや機種によって自動的につくファイル名を変える方法があることがあります。
デジカメのメニューで設定できるものがあるほか、下記の最初の回答のような方法もあります。
http://bbs.kakaku.com/bbs/00502411000/SortID=5319201/
機種名など書かれると、詳しい方がいるかもしれません。


あとついでに、パソコン上でのリネーム方法の補足として下記を。
http://q.hatena.ne.jp/1146796502

「リネームソフト」とかでググると色々なソフトが見つかると思います。
この手のツールを使って、カメラAから取り込んだファイルの末尾に -a を付けてカメラBから取り込んだファイル末尾には -b を付けるなど。
そうすればひとつのフォルダに混ぜてコピーしてもファイル名がかぶることはなくなるでしょう。

ふつうはこうします。
http://mbsupport.dip.jp/watson/basis_10.htm

こういったものもあります。
http://enrai.matrix.jp/over.html
http://solidbluesky.com/gettertools.html