Windowsファイル共有で、共有ドライブをローカルのフォルダとして接続する方法はあるでしょうか？

シンボリックリンクを使えば、できると思います。
接続したい共有ドライブを z: 、つなぎたいフォルダを c:\temp\remote とします。

mklink /d c:\temp\remote z:\

管理者権限で実行したコマンドプロンプトから、以下のような mklink コマンドを実行します。

explorer で c:\temp を見ると、remote にはショートカットのような矢印が付いていますが、階層をもぐって行っても、ツリーはc:\temp の下にあるように見えます。

dir コマンドだと、以下のように見えます。

C:\temp>dir
 ドライブ C のボリューム ラベルがありません。
 ...

 C:\temp のディレクトリ

2014/06/11  11:04    <DIR>          .
2014/06/11  11:04    <DIR>          ..
2014/06/11  11:04    <SYMLINKD>     remote [z:\]

cd remote で、階層をもぐって行くこともできます。

Windows の種類なんかが書いてありませんが、Vista 以降で、ファイルシステムが NTFS になってれば大丈夫なはずです。