AWSのEC2で EBSではなくインスタンスストアを使った場合の料金はどこに書いてありますか?

インスタンスストアボリューム

インスタンスのインスタンスタイプにより、インスタンスで使用できるインスタンスストアのサイズ、およびインスタンスストアボリュームで使用されるハードウェアの種類が決まります。インスタンスストアボリュームは、インスタンスの 1 時間あたりのコストに含まれます。

Amazon EC2 インスタンスストア - Amazon Elastic Compute Cloud

Amazon の中の人が公開してる資料。
http://www.slideshare.net/imaifactory/ephemeral-ssd/8

追加料金がない、というのは、考えようによっては、無料で利用できる、とも。

インススタンスストアのストレージにかかる料金は考える必要はないです。EC2料金やデータ転送量だけ気にしておけばよいです。