エクセルVBA(マクロ)でバーコードを生成してはどうでしょう。
有料でかまわないのならこれがいいかとおもいます
http://www.vector.co.jp/soft/winnt/writing/se463594.html
使用するバーコードがCode39であるならこれが使えるかもです。
http://www.vector.co.jp/soft/win95/writing/se364722.html
JANコードならこれが使えるかもです。
http://takashixxx.blog88.fc2.com/blog-entry-23.html
ここに書いてあると思います!