基本的にはてなブックマークで設定したタグはコメントの文字数には反映されない仕様のはずです。
ただし、タグには以下のような制限があります。
タグの入力について
タグで分類
- ひとつのエントリーに記入できるタグは10個まで、利用できる文字数は約全角10文字(32バイト)までです。
- ? / % [ ] : など一部の記号はタグに使えません。
制限に従っていない場合、タグとは見なされずコメントとして判定されるため、コメントの文字数に上乗せされることになります。
自分の設定しているタグの内容が制限事項に従っているかを再度確認して下さい。