はてなブックマークはソーシャルブックマークサービスです。プライベートでも使えますがメインは他の人と情報を共有することにあります。Googleブックマークは基本的には個人用のブックマークがオンラインにあるだけです(公開設定にはできますが)。メリット・デメリットの比較というより、全く別のものとお考えください。
googleは個人情報を収集しているので、ブックマークもそれに加わるのがちがいます。