ﾏｸﾛの動きを途中で 止める方法は いろいろあります｡
たとえば

http://ttssh2.sourceforge.jp/manual/ja/macro/command/pause.html

pause

休止する｡

pause <time>

解説

TTL の実行を <time> 秒だけ休止する｡

http://ttssh2.sourceforge.jp/manual/ja/macro/command/messagebox.html

messagebox

ﾀﾞｲｱﾛｸﾞﾎﾞｯｸｽを開き､ﾕｰｻﾞｰにﾒｯｾｰｼﾞを知らせる｡

messagebox <message> <title>

pauseの場合､後に必ず＜time＞を入れないとｴﾗｰになるようですが､ｴﾗｰを出さずに簡単に止められませんか？

1．ﾏｸﾛの途中でﾏｸﾛの動きを止める方法をご存知ありませんか？

｢途中で止める｣というのは､pause で良いんでしょうか？
｢ﾏｸﾛを中断する｣という意味で｢止める｣と表現しているのであれば､end を使います｡
待ち時間を指定せずに､一時的に処理を待たせることを指しているなら messagebox や inputbox が使えるかも｡

http://ttssh2.sourceforge.jp/manual/ja/macro/command/end.html
http://ttssh2.sourceforge.jp/manual/ja/macro/command/messagebox.html
http://ttssh2.sourceforge.jp/manual/ja/macro/command/inputbox.html

2．16進を10進に変換するｺﾏﾝﾄﾞ等をご存知ありませんか(例：1A→26)

こんな感じ｡最終的に数値として扱いたいか､10進数の文字列として扱いたいかで変わってきます｡

s16 = '0x'
strconcat s16 '1a'
; s16 は '0x1a'

str2int val s16
; val は､数値の 26

int2str s10 val
; s10 は､文字列の '26'

16進表記の文字列の頭に付けるのは､'0x' の代わりに '$' でも大丈夫｡

http://ttssh2.sourceforge.jp/manual/ja/macro/command/strconcat.html
http://ttssh2.sourceforge.jp/manual/ja/macro/command/str2int.html
http://ttssh2.sourceforge.jp/manual/ja/macro/command/int2str.html
http://ttssh2.sourceforge.jp/manual/ja/macro/syntax/formats.html