普通にGoogleｱｶｳﾝﾄを持っていて､Gmailの他にｶﾚﾝﾀﾞｰも使いたいなということでｶﾚﾝﾀﾞｰのｱｶｳﾝﾄを開設したのでしょうか？

それともGoogle Appsｱｶｳﾝﾄの中で､管理者ｱｶｳﾝﾄの他にﾕｰｻﾞｰｱｶｳﾝﾄを作成後､ﾕｰｻﾞｰｱｶｳﾝﾄで作成したｶﾚﾝﾀﾞｰを使っているということなんでしょうか？

いずれにせよ､ｼﾝﾌﾟﾙに1ｱｶｳﾝﾄ1ｶﾚﾝﾀﾞｰで使えば複数のｱｶｳﾝﾄが混在することはなさそうですが｡

混在しているのが嫌なのであれば､新規でGoogleｱｶｳﾝﾄを取得し､ｶﾚﾝﾀﾞｰを開設するのが､一番容易かと思われます｡

以前､会社の同僚がﾏｲｶﾚﾝﾀﾞｰと別のgmailｱﾄﾞﾚｽがひもづいていて悩んでいました｡
結局色々試したのですが解決に至りませんでした｡
そのまま数ヶ月放置したまま使い続けたところいつの間にか直っていたという現象がありました｡
この時社内ではgoogle側のｻｰﾊﾞ内の紐ずけが壊れていたのでは､という予測的解決に至りました｡
解決策ではありませんが､情報提供まで｡

ここが回答です｡
https://support.google.com/accounts/answer/58582
まあ､方法としてはこちらでしょうか｡
http://www.onikohshi.com/google-useful/calender-biz-private/