私も投稿者とまったく同じような状況でした。
確かに切り替えにかかる労力はそれなりにかかります。
2003と201x系の操作の違いに戸惑うでしょうし、やる内容によっては覚えることもあるでしょう。
しかし、戸惑うのは最初の1週間や2週間程度で結果として乗り換えてよかったと思っております。
違いとして一番わかりやすいのが表現力の違いです。
グラフやそれを表す数値などは2003の頃と比べて格段に向上していますし
作業の自動化は補完機能も向上しているので思っているよりはスムーズに移行できるのではないかと思います。
要は慣れているものから乗り換えるのは労力が必要ですが、2003から201x系への乗り換えであれば労力に見合った見返りは十分にあると言えます。