まず、TOPIX連動型投信(1306)はTOPIXに連動するように設定されているので、日経平均と連動するわけではありません。
(日経平均とTOPIXの連動性が高ければ、連動しているようにみえることもありますが)
上場投資信託(ETF)と原指数が連動するのは、
その上場投資信託を運用している会社が裁定をとって連動するようにしているためです。
詳しくは下記のサイトをご覧ください。
ETFって何?|日興アセットマネジメント
http://www.nikkoam.com/products/etf/about
ETFって何?|東証