教えてください。（ポイント高いです。）

清算確定申告が済んでいれば清算所得、まだなら手取り分は残余財産となるかと。

税額 ＝（売却価額−購入価額−売買にともなう経費）×26％

＝売却益×26％

は、未公開株式でも同じです。

売却ではなくても、現金化された価格を売却価額にあてはめます。

税法上は、売却益は０円ですので、課税無しです。

しかし、申告しないのではなく、購入価額を証明する資料を添付して、確定申告しておいた方が、良いでしょう。

質問の内容どおりであれば、株式譲渡所得は0(売却金額-購入金額)なので課税所得は0となり、申告不要です。

すでに株式の譲渡はなされた後のことですから、B社の資産より債権を清算した後の残余財産をAさんの株式保有数に応じて分与された金額が５００万ということでしょう。

出資した金額と同額ということで、課税される心配はなさそうですが、税務署には一度相談したほうが良いでしょう。