現在、自前でメールサーバとＷＥＢサーバを、一応管理していますが、サイトへのアクセス環境の改善のために、ＷＥＢサーバのみをレンタルサーバー（厳密にはラピッドサイトのＶＰＳサーバ　ＲＶ３１２プラン）への移行を考えています。ただし、メールサーバは自分のサーバで引き続き、扱っていきたいと考えています。

また自前のサーバには独自ドメインを設定しています。

そこで
レンタルサーバに独自ドメインを設定して、ＷＥＢサーバを移行した場合に、メールサーバのＤＮＳ設定は別にできるんでしょうか？つまりレンタルサーバ先ではメールサーバの設定を行わず、使わないで、今までどおりメールサーバは自前のサーバでまかなうという方法ができるか？
という質問です。

ＷＥＢサーバとメールサーバは別物だと思っているのですが、もしかしたらレンタルサーバでは、ＤＮＳ設定が両方まとめてしか管理できないようになっているのでは？と心配しています。

ネットワーク等は疎いので質問自体がおかしいかもしれませんが、誰かわかる方、経験のある方がいればお答え下さい。