ファイルの圧縮解凍ツールを使って圧縮⇒解凍すると、タイムスタンプに１秒ほどの誤差が出ることがありますが、どのような原因でしょうか？

ソースはありませんが、1の方が言うとおり、秒は偶数秒の格納しかできません。
なので、奇数秒のファイルをFATに保存すると偶数秒に変換されずれてしまします。
以前、プログラミングをしていて結構おおざっぱだなぁと思いました。

たびたびすみません。
圧縮のタイプによりかもしれませんが、
圧縮の際にすでに偶数秒に変換されているかと思います。

FATの時刻を保存するタイムスタンプは、
奇数秒のデータを保存する事が出来ません。
従って最大＋・－１秒程度の誤差が発生します。


NTFSからFATへのファイルのコピー時に日時が変わる
http://support.microsoft.com/default.aspx?scid=kb;ja;JP402160

詳細は、以下 WIKIPEDIAの Directory Table
のByte Offset 0x0eの Seconds(秒)の保存する場所が
によります。
FATの技術解説
http://en.wikipedia.org/wiki/File_Allocation_Table

http://support.microsoft.com/default.aspx?scid=kb;ja;100108