最近、広告記事なのに、広告記事と分からないものがありますが、厳密には問題はないのでしょうか。あるのでしょうか。

問題はありません

景品表示法、薬事法、業界の公正競争規約

これらに違反しなければ構わないことになっています

http://www.jftc.go.jp/keihyo/hujisyo.html

また　何の広告なのか分からない　というのは意図してそのように広告しているので

普通に広告するよりその方が効果が高いと考えていると思われます

http://blog.livedoor.jp/koumuten1/archives/51022800.html

俗にいう「ペイドパブ」（paid publicity）の事ですね。

ページに「広告企画」「PR」等明示することが、ルールになっているようです。（正式ルールか暗黙かは不明）

Wikipediaに「記事広告」という項目で問題点に少し言及しています。

個人的には、最近の一部IT系雑誌って、半分の量が「広告企画」だったりして、何だかなあという感じです。