従業員の平均年収という項目が、会社四季報にはありますが、

諸手当は含まれているっぽいですね。

https://newtrading.etrade.ne.jp/ETGate/WPLETmgR001Control?getFlg...

>原則、平均年収（［年］と表示）で、 税込み、残業料・諸手当・賞与を含んだ金額です（有価証券報告書記載基準によります）。年収についても、原則、本決算ベースですが、決算期を変更した会社は年換算した数値を掲載しています。平均年齢、給与は原則、本決算ベースです。

年収に手当は含まれません。

確定申告で所得にあたる分と考えるとわかりやすいでしょう。

minkpaさんはいいかげんな回答が多いですから、気にしないほうが良いかもしれません。

sylphid666さんのおっしゃるように有価証券報告書記載基準を元に作成しているので、緒手当てを含みます。

ただ、実際に企業に話を聞くと、一部の上場企業などは、実際の給与はもっと高いところもありますね。（あくまで原則ということ）

http://www.topmr.com/mr/index11.html

＞■ 平均年収の比較

参考までに、製薬各社が発表している

手当てを含めた平均年収の報告をご紹介いたします。

・・・・・

このように製薬会社の年収は、他の業種の大手企業と比較しても

高い水準にあることがわかります。

類似質問　　↓

http://q.hatena.ne.jp/1148711381

住宅手当を手当てとして支給されたら、所得税とかの対象ですが、

会社名義でマンションを借りてもらって、社宅費用として会社に支払えば

すり抜けれます。

＞住宅手当でもかなりの額(３桁万とか話に聞いたことがあります)に

＞なっている会社もあると思うのです

持ち家をもったら、さすがに支給されないと思うので、

そんなに年収があれば、家やマンションを購入するんじゃないかな。

他の方の回答にあるように、手当てとして支給されている分は含まれています。

ただ、住宅手当として年120万支給されていると、給与として計算されますが、社宅であれば月20万円のアパートを会社が借上げていても、給与としては計算されません。

細かい点は無視すると、一般的に「収入」といえば控除前の額面金額（事業者なら売上）、「所得」と言えば控除後（事業者なら利益）を指しますね。