ご存知かもしれませんが、
LPICという資格の本が良いと思います。
ついでにこの資格もとってしまうと良いかもしれません。
因みに私自身も勉強中です。
http://www.amazon.co.jp/Linux-%E6%95%99%E7%A7%91%E6%9B%B8-LPIC%E...
特定のOSを使いこなすということは「カーネルの機能について理解してプログラミングができる。」とか「デバイスドライバを書くことができる」なんていうことだとおもいます。
Linuxシステムプログラミング
著者:垰井正雄、羽山博
出版社情報 http://ssl.ohmsha.co.jp/cgi-bin/menu.cgi?ISBN=4-274-07972-4
C言語による実践Linuxシステムプログラミング
著者:小俣光之
出版社情報 http://www.shuwasystem.co.jp/cgi-bin/detail.cgi?isbn=978-4-7980-...
技術書ではないけど
GPLとストールマン、linuxとリーナス関連の本は読むべきだと思う
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