pdfファイルの編集（文字の置換）などを行うのに、市販のソフトがAcrobat Professionalより優れている点はありますか

大抵の場合、Acrobat Professionalよりも価格が安いという優れた点があります。

「市販のソフト」というのは、随分、大きな括りだと思いますが。。。

価格が安いとこが、一番ではないでしょうか。

機能面では本家の方が一日の長があるので、優れている点といえばやはりコストパフォーマンスでしょう。

Acrobatは、Acrobat 9 Standard/Pro/Pro Extendedと、ラインナップが拡大されて（名称も微妙に変更されて）いますが、用途によってはStandardほどの機能も必要ではないシーンが多くあります。

http://www.adobe.com/jp/products/acrobat/matrix.html

そのような時に、Acrobatシリーズ以外の市販ソフトウェア（フリーウェアやシェアウェアを含む）で、ある程度の機能を持つツールは、十分魅力的だと思います。